在豆制品生產(chǎn)過程中產(chǎn)生的廢水里，泡豆水中的雜質(zhì)比較多，而清洗設(shè)備所用的水可以進行循環(huán)利用，大豆黃漿水中的可回收成分含量較高，所以對廢水綜合利用的研究對象主要是黃漿水。大豆黃漿水中含有大豆乳清蛋白、多肽、低聚糖以及異黃酮等有機成分，常用的處理廢水的方法是利用好氧或者厭氧的方法對廢水進行消化使其達到污水排放標(biāo)準(zhǔn)后排放，這種處理方法雖然非常有效，但是處理廢水的工序比較復(fù)雜且需要一定的設(shè)備以及運行成本，最后還得不到任何的回報，是十分不經(jīng)濟的。綜合處理豆制品廢水是回收利用其中的有效成分，并且在回收以后能明顯的降低廢水的 COD、可溶性固形物含量以及其他指標(biāo)，這樣做既有效地處理了廢水，又使得對豆制品廢水處理的投入有了回報，是一舉兩得的事情。

豆制品廢水中的成分和利用堿溶酸沉法生產(chǎn)大豆蛋白時所產(chǎn)生的大豆乳清廢水的成分極為相似，其主要成分都是水溶性好的糖和未沉淀的蛋白，處理豆制品廢水的方法也可以參考處理大豆乳清廢水的方法來進行。大豆黃漿水盡管是高濃度的有機廢水，但是原料濃度增大可以提高處理的效率。

有人使用兩級納濾連接反滲透工藝模擬處理大豆乳清廢水，通過兩級納濾的透過液中不再含有大豆蛋白質(zhì)，溶液中大部分 NaCl 透過了納濾膜，這樣可以有效地對大豆乳清廢水進行濃縮和除鹽，得到的納濾透過液可以通過反滲透來對其進行脫鹽，并得到濃鹽水和 RO 水。還有人使用冷凍濃縮的方式處理豆腐廢水，通過三級冷凍濃縮可使豆腐廢水中可溶性固形物含量從1.9°Brix 提高到 15.5°Brix，在保留絕大部分功能性成分的前提下有效地對廢水進行了濃縮。

豆制品廢水通過多級冷凍濃縮進行預(yù)處理，可提高絕大部分功能性成分的保留效率。采用膜分離和絮凝等技術(shù)可以從豆制品廢水中分離大豆乳清蛋白、大豆低聚糖和大豆異黃酮等產(chǎn)物。向豆制品廢水中加入微生物所需的營養(yǎng)物質(zhì)再滅菌后可制成微生物培養(yǎng)液，用于培養(yǎng)微生物以獲得菌體或副產(chǎn)物。